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Wacquet

Guillaume

par Valérie PLOUVIN - publié le , mis à jour le

Post Doc ULCO (Chercheur post-doctorant en Automatique, Traitement du Signal et des Images)

Adresse Contact
Maison de la Recherche en Environnement Naturel Tél : 03 21 99 64 27
32 avenue Foch Fax : 03 21 99 64 01
62930 Wimereux, france Mél : Guillaume Wacquet

Titre du projet de recherche :
Amélioration de l’étude et du suivi des espèces phytoplanctoniques dominantes
dans la Manche orientale, en focalisant à la fois sur les petites cellules et les
espèces coloniales.

Compétences scientifiques
Machine Learning, DataMining, Informatique Industrielle, Traitement du Signal et de l’Image :
Reconnaissance de formes. Extraction d’information. Classification supervisée, non supervisée et
semi-supervisée. Apprentissage automatique. Génie logiciel et programmation.

Formation et titres

- 2011  : Diplôme de Doctorat en Génie Informatique, Automatique et Traitement du Signal.

Thèse soutenue publiquement le 08 décembre 2011 à l’Université du Littoral Côte d’Opale.
Titre : « Classification spectrale semi-supervisée. Application à la surveillance de
l’écosystème marin ». Laboratoire : Laboratoire d’Informatique Signal et Image de la Côte d’Opale (LISIC).

- 2006-2008  : Master Ingénierie Numérique, Signal, Image et Informatique Industrielle (INS3I). Université du Littoral Côte d’Opale.

- 2005-2006 : Licence Génie des Systèmes Industriels (GSI).
Université du Littoral Côte d’Opale.

- 2003-2005  : DUT Génie Électrique et Informatique Industrielle (GEII).
IUT de Calais.

Expérience professionnelle

- Juin 2014 – Sept. 2015  : Chercheur post-doctorant.
Institut de recherche : Université de Mons (Belgique).
Laboratoire d’accueil : Laboratoire d’Écologie Numérique des Milieux Aquatiques.
➢ Optimisation des algorithmes de classification semi-supervisée, et développement de méthodes d’apprentissage actif pour la reconnaissance d’images.

- Nov. 2012 – Mai 2014 : Chercheur post-doctorant.
Institut de recherche : IFREMER - Centre Manche - Mer du Nord.
Laboratoire d’accueil : Laboratoire Environnement Ressources (LER).
- Détection optique, traitement et classification (semi-)automatique de particules
phytoplanctoniques pour la surveillance de l’état écologique des masses d’eau.

- Avr. 2012 - Nov. 2012  : Chercheur post-doctorant.
Institut de recherche : Université du Littoral Côte d’Opale.
Laboratoire d’accueil : Laboratoire d’Informatique Signal et Image de la Côte d’Opale
(LISIC)
- Classification et analyse statistique de différents échantillons marins par analyse de
signaux et d’images.

Oct. 2011 – Mars 2012  : Ingénieur d’études.
Université du Littoral Côte d’Opale.
Laboratoire d’accueil : Laboratoire d’Informatique Signal et Image de la Côte d’Opale
(LISIC)
- Développement d’une toolbox R de classification semi-supervisée pour la caractérisation de l’écosystème marin via un cytomètre en flux.

-  2008-2011 : Moniteur CIES Nord-Pas-de-Calais-Picardie, section CNU 61.
Université du Littoral Côte d’Opale.
- Filières : Licence 2 GSI, Master 2 INS3I, Master 2 ISIDIS (Informatique).
- Disciplines : Automatique et Automatisme, Formalisation et Implantation de Systèmes
Distribués, Analyse statistique, Fouille de données, Machine Learning.
- Volume horaire total : 115h Eq TD.

Peer-reviewed publications

Wacquet G., Poisson-Caillault É., Hamad D., and Hébert P.-A., “Constrained Spectral Embedding for K-Way Data Clustering”. Pattern Recognition Letters Journal, ISSN:0167-8655 / Elsevier, Vol. 34, pp. 1009-1017, 2014.

Wacquet G., Poisson-Caillault É., Hébert P.-A., “Semi-Supervised K-Way Spectral Clustering with Determination of Number of Clusters”. Studies in Computational Intelligence, ISSN : 1860-949 / Springer-Verlag Berlin Heidelberg, Vol. 465, pp. 317-332, 2013.

Non-peer-reviewed publications

Wacquet G., Grosjean Ph., Colas F., Hamad D., Artigas L.-F., “Version évolutive de l’outil opérationnel de numérisation et d’analyse semi-automatique d’images de phytoplancton, utilisant le matériel FlowCAM et le logiciel ZooPhytoImage. Nouvelles perspectives”. Convention ONEMAIFREMER,
Action 9, FlowCAM/ZooPhytoImage. Livrable n°1, 190 pages, 2015.

Wacquet G., Lefebvre A., “Protocole sur les outils de reconnaissance optimisés Manche- Atlantique”. Convention ONEMA-IFREMER, Action 9, FlowCAM/ZooPhytoImage. Livrable n°2, 239 pages, 2014.

Wacquet G., Lefebvre A., Colas F., Grosjean Ph., “Finalisation d’un outil pré-opérationnel FlowCAM/ZooPhytoImage ”. Convention ONEMA-IFREMER, Action 9, FlowCAM/ZooPhytoImage. Livrable n°3, 150 pages, 2014.

Ali N., Wacquet G., Didry M., Hamad D., Artigas L.-F., Grosjean Ph., “Utilisation conjointe de FlowCAM/ZooPhytoImage et de la cytométrie en flux. Premiers résultats et perspectives”. Convention ONEMA-IFREMER, Action 9, FlowCAM/ZooPhytoImage. Livrable n°4, 104 pages, 2014.

Wacquet G., “Outil de détermination du nombre de cellules par colonie de phytoplancton”. Rapport d’activités Mars 2013, Ifremer/RST/LER.BL.13.04, 2013.
Wacquet G., “Classification spectrale semi-supervisée. Application à la surveillance de
l’écosystème marin”. Thèse de Doctorat, Laboratoire d’Informatique, Signal et Image de la Côte d’Opale, Université du Littoral Côte d’Opale, 225 pages, soutenue publiquement le 08 décembre 2011.

Wacquet G., “Classification de signaux issus de mesures cytomètriques”. Rapport de stage de deuxième année de Master INS3I, Université du Littoral Côte d’Opale, Calais, 47 pages, 17 mars-13 septembre, 2008.

Conferences / Workshops

Wacquet G., Grosjean Ph., Hamad D., Lefebvre A., Neaud-Masson N., Colas F., Maurer D., Artigas L.-F., Belin C., “ZooPhytoImage : current advances in the semi-automated classification of plankton digital images”. Conférence GdR PhycoTox – GIS Cyano, Brest, France, 31 mars - 02 avril, 2015.

Grosjean Ph., Denis K., Wacquet G., Ali N., Rousseau V., Parent J.-Y., Lancelot C., “Towards a better classification of plankton digital images : suspect detection, error correction and real-time”. ASLO Aquatic Sciences Meeting, Granada, Spain, 22-27 February, 2015.

Wacquet G., Lefebvre A., Colas F., Grosjean Ph., Belin C., “Détection optique et classification semi-automatisée du phytoplancton pr le système couplé FlowCAM/PhytoImage”. Instrumentation haute fréquence pour l’observation et la surveillance de l’environnement marin, Colloque MAREL, Boulogne-sur-Mer, France, 12-13 juin, 2014.

Wacquet G., Lefebvre A., Colas F., Belin C., “FlowCAM : An imaging-in-flow system”. Outils de reconnaissance semi-automatisés pour l’observation du phytoplancton, WorkShop RESOMARDYMAPHY, Station Marine de Wimereux, France, 04-06 décembre, 2013.

Wacquet G., Poisson-Caillault É., Hamad D., Hébert P.-A., “Constrained Spectral Clustering Algorithm : FCM application”. Colloque de restitution finale du projet INTERREG IV A DYMAPHY, Boulogne-sur-Mer, France, December 02-03, 2013.

Wacquet G., Lefebvre A., Grosjean Ph., Belin C., “Optical detection and automatic classification of phytoplankton by the coupled system FlowCAM/PhytoImage”. JERICO WorkShop WP10, Observatoire Océanologique de Villefranche-sur-Mer, France, October 16-18, 2013.

Wacquet G., “Unsupervised and Semi-Supervised Classification of Phytoplanktonic Cells (CAL-2)”. DYMAPHY Project, Middelburg, The Netherlands, November 21-24, 2011.

Wacquet G., Hébert P.-A., Poisson-Caillault É., and Hamad D., “Semi-Supervised K-Way Spectral Clustering using Pairwise Constraints”. International Conference on Neural Computation Theory and Applications, NCTA, Paris, France, pp. 72-81, October 24-26, 2011.

Wacquet G., Hamad D., and Artigas L.F., “Classification spectrale semi-supervisée. Application à la surveillance de l’écosystème marin”. 4èmeWorkshop du Groupement d’Intérêt Scientifique, Surveillance, Sûreté et Sécurité des Grands Systèmes, GIS 3SGS, Valenciennes, France, 12-13 octobre, 2011.

Wacquet G., Hébert P.-A., Poisson-Caillault É., et Hamad D., “Classification Semi- Supervisée pour l’Identification de Cellules Phytoplanctoniques”. STIC et Environnement, Colloque Sciences et Techniques de l’Information et de la Communication Pour l’Environnement, Saint-Étienne, France, pp. 15-28, 11-13 mai, 2011. Prix Jeune Chercheur.

Poisson-Caillault É., and Wacquet G., “Data analysis”. DYMAPHY Project, CEFAS, Lowerstoft, United Kingdom, March 23, 2011.

Wacquet G., “Automatic Classification of Phytoplanktonic Cells”. Workshop on data analysis in Flow Cytometry , Delft, The Netherlands, March 23-24, 2010.

Caillault É., Hébert P.-A., and Wacquet G., “Dissimilarity-based classification of multidimensional signals by conjoint elastic matching : Application to phytoplanktonic species recognition”. Engineering Applications of Neural Networks, London, United Kingdom, pp. 153-164, August 27- 29, 2009