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Atelier RESOMAR "Molecular tools for addressing marine microbial diversity"

(UMR 8187 LOG CNRS - ULCO - ULILLE / IFREMER)

par Valérie PLOUVIN - publié le , mis à jour le

Organisateurs : Felipe Artigas et Sébastien Monchy

Date : du 16 au 18 janvier 2019

Lieu : au LOG (MREN ULCO) à Wimereux.

Résumé :
L’atelier RESOMAR "Molecular tools for addressing marine microbial diversity" vise à faire le point sur l’utilisation des outils de biologie moléculaire, et plus particulièrement de séquençage à haut débit, dans les études de diversité et de fonctionnement des écosystèmes aquatiques, d’en faire un bilan, et d’étudier la possibilité de rendre interopérable le suivi de la diversité microbienne via ces approches au sein des systèmes d’observation des milieux marins côtiers. Le programme est organisé en trois parties/temps : i) Présentation des aspects théoriques et techniques des outils moléculaires et, en particulier, du métabarcoding. ii) Présentation des résultats obtenus au cours des suivis de la diversité microbienne (procaryote et protistes eucaryotes) réalisés dans les laboratoires affiliés au RESOMAR, ainsi que des apports nouveaux et complémentarité par rapport à d’autres approches. iii) Discussion quant aux aspects pratiques de la mise en place d’une initiative d’observation de la diversité microbienne par métabarcoding : sites, budget, faisabilité des analyses, analyses de données / métadonnées, bancarisation et plateforme de visualisation/traitement des résultats, élaboration d’un cahier de charges, modalités d’incorporation dans les réseaux existant... In fine, cet atelier est l’occasion de discuter des aspects théoriques et techniques, de standardiser et d’homogénéiser les pratiques, mais aussi de mutualiser les expériences, les compétences, les données et éventuellement les moyens mis en œuvre pour la mise en place d’une initiative conjointe d’observation des systèmes marins côtièrs par approches moléculaires.

Comité d’organisateur local  :

- ARTIGAS FELIPE felipe.artigas@cnrs.fr MCU ULCO - LOG CNRS UMR 8187 - Wimereux

- BIARD TRISTAN Tristan.biard@univ-littoral.fr MCU ULCO - CNRS UMR 8187 LOG - Wimereux

- IRION SOLENE Solene.Irion@univ-littoral.fr Doctorante ULCO - CNRS UMR 8187 LOG - MREN Wimereux

- MARQUANT MICHELLE Michelle.Marquant@univ-littoral.fr ULCO - CNRS UMR 8187 LOG - MREN Wimereux

- MONCHY SEBASTIEN Sebastien.Monchy@univ-littoral.fr PR ULCO - ULCO - CNRS UMR 8187 LOG - MREN Wimereux

- PLOUVIN VALERIE valerie.plouvin@univ-lille.fr CNRS UMR 8187 LOG - Wimereux

- SASSENHAGEN INGRID Ingrid.Sassenhagen@univ-littoral.fr Post-Doc ULCO - CNRS UMR 8187 LOG - Wimereux